Projekti rakendamise faasis on oluline tagada, et kõik tegevused ja kulutused, mis on planeeritud, tehakse ära projekti perioodil. Mõne meetme puhul on võimalik, kui nii on rahastamislepingus kokku lepitud, teha kulutusi veel teatud arv päevi pärast projekti abikõlblikkuse perioodi lõppu. Selliste kulutuste alla kuuluvad näiteks töötasudega seotud maksude tasumine või ka arvete tasumine, mis on esitatud abikõlblikkuse perioodil, kuid mille tasumise tähtaeg on peale seda.
Projekt lõppeb, kui viimane aruanne on ära kinnitatud, laekunud on viimane toetuse summa ja vajadusel on finantsallikale kantud omafinantseering ning mitteabikõlblikke kulude katmiseks vahendid.
Mitmete fondide puhul on kohustus aru anda ka peale projekti lõppu, tavaliselt 5 aasta jooksul peale viimase makse laekumist – teavitada majandustegevusest (taristuprojektide puhul), publikatsioonidest (H2020 projektide puhul vaata ka osa „Publikatsioonid, projektide tulemustest teavitamine projekti ajal ja peale projekti lõppu“)